白城医学高等专科学校建于1958年，当时隶属省卫生厅。1962年下放地方并调整为中专。1985年以来，先后与原白求恩医科大学等三所高校开展联合办学。1998、1999年先后晋升为省部级重点校、国家级重点示范校。2001年与吉林大学共建吉林大学白城医学院，2002年白城粮食学校并入，2004年经教育部批准恢复专科学校。同年6月，原白城铁路医院划归学校作为附属医院。2011年12月经省政府批准上划省管，成为吉林西部、大兴安岭南麓扶贫片区唯一一所省属医学类高等专科学校。2017年，成为全省现代职业教育改革发展示范校。

2020年，学校新增土地33.8万平方米，校园占地面积65万平方米,建筑面积17.94万平方米。现有教职工673人(其中附属医院294人)，有专任教师451人,具有副高级以上职称188人，其中二级教授2人，三级教授2人，省拔尖创新人才6人。具有博士、硕士研究生学位教师165人，“双师型”教师223人。有省级优秀教学团队5个，建立专家工作室5个，中国工程院陈香美院士等10名专家为学校名誉校长、特聘教授。

学校设有护理学院、口腔学院等十一个院(系、部),开设临床医学、口腔医学技术、家政服务与管理、老年保健与管理、幼儿发展与健康管理等20个专业，在校生9442人。

学校多次荣获“省精神文明建设工作先进单位”、“省军(警)民共建精神文明先进单位”、“省级花园式学校”、“绿色生态校园”和吉林省劳动模范集体、教育系统创先争优活动先进集体、“吉林省文明单位”等项荣誉。2012年,被吉林省招生委员会和吉林省教育厅评为“全省招生工作先进单位”。2016年被评为“吉林省首届黄炎培职业教育优秀学校”。2017年获批“国家级职业院校数字校园建设实验校”。2018年荣获“高等职业院校现代学徒制试点校”。2019年获批“吉林省现代职业教育改革发展示范校”，并被评“吉林省高教科研工作先进单位”荣誉称号。